自清洗过滤器具有自动清洗、自动排污、清洗不断流、自动化程度高等诸多优点，所以在许多领域中有着相当广泛的应用，同时在使用自清洗过滤器的过程当中可能会遇到许多问题和故障，从而影响水系统的正常运行。下面就简单分析一下自清洗过滤器容易出现的一些问题和相应的解决办法。
一、自清洗过滤器出现漏水 自清洗过滤器的漏水问题一般会出现在过滤器的传动轴部分（筒体、法兰焊接部分漏水不在此范围之内），出现这种问题基本有两种原因，一是传动轴密封圈材质或规格不符合要求，因此更换符合要求的密封圈就行。二是密封圈经过长时间运行出现磨损，引起传动轴和过滤器本体间密封不严而出现漏水，像这种情况更换相应规格的密封圈就可以解决问题。
二、自清洗过滤器的自动排污阀故障 有的用户的系统的自清洗过滤器在使用较长的一段时间后会出现自动排污阀故障，具体表现为过滤器的自动清洗时排污阀不动作或排污阀打不开一直关闭不了，出现这种问题的自清洗过滤器的生产厂家一般是选用国产的电磁阀作为排污阀使用，这种电磁阀为先导式，先由电磁铁打开先导孔，然后依靠系统内水的压力冲开隔膜开启阀门。由于排污水中含有许多杂质，非常容易堵住先导孔，造成电磁阀不动作或打开后关闭不严。选用电动球阀或水力电磁阀作为排污阀就完全解决了普通电磁阀作为自清洗过滤器自动排污阀容易出故障的问题。
三、自动清洗控制系统故障 有的用户在使用自清洗过滤器的过程中会发现自清洗过滤器启动频繁引起清洗水量增加，过滤器寿命缩短的问题，出现这个问题都是由过滤器的自控系统出现故障或参数设置引起的。这里面主要是差压控制器的清洗差压和清洗时间的设置问题。过滤器清洗系统启动频繁一般可能通过设置更大的差压范围或调整控制系统的清洗时间来解决 。